Nachdem auch Lord Zedd die Power Rangers nicht besiegen konnte, erscheint Ritas Bruder Rito Revolto und zerstört die Donnerzords der Power Rangers. Damit haben die Power Rangers ihre Verwandlungskräfte verloren. Zordon schickt sie zu Ninjor, der ihnen die neue Ninja Power überreicht. Nun verfügen die Power Rangers zum einen über Ninja-Anzüge gegen die Tengu-Krieger und zum anderen über Ranger-Anzüge, die ihren alten gleichen. Zur neuen Ninja Power gehören auch die Ninjazords, mit denen Rito, Rita und Lord Zedd zurückgedrängt werden können. Später gelingt es Finster alte Zords ausfindig zu machen. Lord Zedd will sie mit den Power Rangers als Piloten benutzen, aber die Zords wechseln jedoch auf die Seite der Power Rangers und kommen als Shogunzords zum Einsatz. Als Katherine neu in die Stadt Angel Grove kommt, beeinflusst Rita sie durch einen Zauber gegen die Power Rangers und nimmt dabei den Falkenzord und Ninjor gefangen. Als Katherine vom Zauber befreit wird, gibt ihr Kimberly ihre Pink Ranger Power, da sie sich entschlossen hat, an den Weltfestspielen in Gymnastik teilzunehmen. Zu allem Überfluss erscheint noch Rita und Ritos Vater, der Meister des Schreckens, der mit Ninjors Hilfe an den Zeo-Kristall kommen möchte. Die Power Rangers zerstören den Kristall jedoch lieber als diesen ihm zu überlassen und zerstreuen die Teilsplitter an verschiedenen Orten in verschiedenen Zeitepochen. Der Meister des Schreckens rächt sich, indem er die Erde rückwärts drehen lässt, sodass sich die Zeit zurückdreht und verwandelt die Power Rangers somit zurück in ihre Kindheit. Die Alien Rangers (auch Aquitar Rangers genannt) kommen vom Planeten Aquitar und sind für die Power Rangers eingesprungen, nachdem diese vom Meister des Schreckens in Kinder verwandelt wurden. Nachdem sie den Meister des Schreckens vertreiben konnten und die Kinder den Zeo-Kristall und somit die normale Zeit wiederhergestellt haben, ziehen sich die Alien Rangers wieder auf ihren Planeten zurück. Inzwischen gelangen Rito und Goldar in die Kommandozentrale von Zordon und zünden eine Bombe. Dabei gelingt es ihnen den Zeo-Kristall zu stehlen und die Kommandozentrale zu zerstören. Die Handlung wird in der nächsten Staffelserie Power Rangers Zeo fortgesetzt.