Een onverklaarbare, lokale splitsing in de atmosfeer veroorzaakt een reeks totaal onvoorspelbare, maar verwoestende tornado's. Rookie-brandweerman Brian Flynn komt vast te zitten in het ondergrondse riool met zijn vriendin, loco-burgemeester James 'Jim' Lawrence en de nicht Lori van klimatoloog Dr. Cassie Lawrence. Burgemeester Leonardo van New York weigert aanvankelijk voldoende aandacht te besteden aan het fenomeen, een ‘herverkiezingsdreiging’, waardoor de alarmstatus lang te laag blijft. Atypische bliksem ontdekt in tornado's voegt ongekende gevaren toe. De Lawrences en de afvallige luchtvaart Dr. Lars Liggenhorn bedenken een mogelijke oplossing door raketten te lanceren, maar Dr. Quinn van NASA negeert ze en legt standaard zilverjodium op.
